La composición actual de la Comisión Ejecutiva de AENUI es la siguiente:
- Faraón Llorens. Universidad de Alicante. Coordinador.
- David López. Universitat Politècnica de Catalunya. Subcoordinador.
- Mª José García. Universidad Europea. Subcoordinadora.
- Imanol Usandizaga. Universidad del País Vasco. Secretario
Sus principales funciones son:
- Velar para que se lleven a cabo los acuerdos dictados por la Asamblea.
- Resolver los asuntos cotidianos de funcionamiento de la Asociación.