La composición actual de la Comisión Ejecutiva de AENUI es la siguiente:

• Faraón Llorens. Universidad de Alicante. Coordinador.
• David López. Universitat Politècnica de Catalunya. Subcoordinador.
• Mª José García. Universidad Europea. Subcoordinadora.
• Imanol Usandizaga. Universidad del País Vasco. Secretario

Sus principales funciones son:

• Velar para que se lleven a cabo los acuerdos dictados por la Asamblea.
• Resolver los asuntos cotidianos de funcionamiento de la Asociación.